Thursday, June 6, 2013

There are 145 unique species of babblers to be used in my analysis.

> library(plyr)
> babblers.species.count<-ddply(.data=new.babblers, .(Genus, Species), species.count=length(Wing.Length), summarize)
> babblers.species.count

                   Genus         Species species.count
1             Actinodura        egertoni             6
2             Actinodura    morrisoniana             3
3             Actinodura      nipalensis             3
4             Actinodura         waldeni             5
5                Alcippe    brunneicauda             4
6                Alcippe          grotei            11
7                Alcippe      morrisonia             5
8                Alcippe      peracensis             2
9                Alcippe    poioicephala            11
10               Alcippe     rufogularis             5
11                 Babax      lanceolata             4
12             Chrysomma         sinense             6
13  Chrysomma (Moupinia)      poecilotis             4
14                 Cutia      nipalensis             7
15              Dumentia      hyperythra             6
16        Gampsorhynchus         rufulus             8
17              Garrulax         affinis            11
18              Garrulax     albogularis             5
19              Garrulax         canorus            14
20              Garrulax       chinensis            40
21              Garrulax      cineraceus             4
22              Garrulax erythrocephalus             1
23              Garrulax        formosus             4
24              Garrulax     leucolophus            41
25              Garrulax        lineatus             6
26              Garrulax           maesi             3
27              Garrulax       merulinus             1
28              Garrulax         milleti             1
29              Garrulax          milnei             4
30              Garrulax        mitratus             6
31              Garrulax       monileger             8
32              Garrulax        nuchalis             3
33              Garrulax       ocellatus             7
34              Garrulax       palliatus             4
35              Garrulax      pectoralis             1
36              Garrulax  perspicillatus            14
37              Garrulax poecilorhynchus             4
38              Garrulax          sannio            12
39              Garrulax         sinesis             9
40              Garrulax       squamatus             3
41              Garrulax        striatus             6
42              Garrulax     subunicolor             6
43              Garrulax      variegatum             3
44              Garrulax         vassali             7
45              Garrulax        virgatus             2
46         Heterophaesia       annectens             4
47         Heterophaesia     auricularis             3
48         Heterophaesia      capistrata             6
49         Heterophaesia      desgodinsi             1
50         Heterophaesia        gracilis             4
51         Heterophaesia    maelanoleuca             9
52         Heterophaesia       picaoides             7
53         Heterophaesia       pulchella             3
54          Heterophasia      desgodinsi             7
55           Illadopsis       albipectus             4
56           Illadopsis         cleaveri             4
57           Illadopsis       fulvescens             8
58           Illadopsis           puveli             2
59           Illadopsis      pyrrhoptera             2
60           Illadopsis        rufescens             3
61           Illadopsis       rufipennis             6
62               Kenopia         striata             2
63             Leiothrix     argentauris            15
64             Leiothrix           lutea             4
65            Leonardina           woodi             1
66             Liocichla       phoenicea             1
67             Liocichla         steerii             3
68              Macronus         gularis            25
69              Macronus        ptilosus             3
70              Macronus     striaticeps            12
71          Malacocincla         abbotti             4
72          Malacocincla     cinereiceps             2
73          Malacocincla     malaccensis             6
74          Malacocincla        sepiaria             3
75          Malacopteron          affine             3
76          Malacopteron      albogulare             4
77          Malacopteron        cinereum             1
78          Malacopteron     magnirostre             7
79          Malacopteron          magnum             5
80          Malacopteron    palawanenese             3
81                 Malia           grata             6
82         Micromacronus        sordidus             2
83                 Minla      ignotincta             6
84                 Minla        strigula             7
85             Napothera    brevicaudata             4
86             Napothera          crassa             2
87             Napothera     crispifrons             7
88             Napothera     epilepidota            10
89            Pellorneum      albiventre             9
90            Pellorneum    capristratum            15
91            Pellorneum      pyrrogenys             6
92            Pellorneum        ruficeps             5
93            Pellorneum        tickelli             1
94           Phyllanthus      atripennis             6
95              Pnoepyga         pusilla             1
96          Pomatorhinus    erythrogenys            18
97          Pomatorhinus    ferruginosus             4
98          Pomatorhinus      horsfieldi             6
99          Pomatorhinus      hypoleucos             4
100         Pomatorhinus        montanus             4
101         Pomatorhinus      ruficollis             9
102         Pomatorhinus        swinhoei             2
103          Ptilocichla         falcata             2
104          Ptilocichla   leucogrammica             3
105          Ptilocichla     mindanensis             3
106            Ptyrticus        turdinus             6
107         Rhopocichla         atriceps             4
108              Rimator    malacoptilus             3
109         Schoeniparus         brunnea            10
110         Schoeniparus     castaneceps             1
111         Schoeniparus         cinerea             3
112         Schoeniparus           dubia             6
113         Schoeniparus     rufogularis             4
114          Spelaeornis    chocolatinus             5
115          Spelaeornis        formosus             2
116          Spelaeornis   troglodytoide             3
117         Sphenocichla           humei             3
118            Stachyris         ambigua             4
119            Stachyris        chrysaea            11
120            Stachyris    erythroptera             8
121            Stachyris      grammiceps             2
122            Stachyris        leucotis             3
123            Stachyris        maculata             3
124            Stachyris    melanothorax             6
125            Stachyris       nigriceps             7
126            Stachyris     nigricollis             4
127            Stachyris           oglei             3
128            Stachyris    poliocephala             4
129            Stachyris        pyrrhops             3
130            Stachyris        ruficeps            10
131            Stachyris       rufifrons             3
132            Stachyris       striolata             5
133            Stachyris       thoracica             4
134              Timalia         pileata             8
135          Trichastoma         bicolor             4
136          Trichastoma       celebense            11
137          Trichastoma       rostratum             5
138          Trichastoma        tickelli            10
139          Trichastona        tickelli             2
140            Turdoides         bicolor             3
141            Turdoides         gularis             4
142            Turdoides       jardineii            10
143            Turdoides        plebejus            16
144            Turdoides      reinwardii             3
145        Xiphirhynchus   superciliaris             3

No comments:

Post a Comment